caractères spécifiques aux expressions régulières python, toute combinaison

Question

J'essaie donc de créer une clause regex où il peut détecter toute combinaison de caractères 'ACTG' et accepter cela comme valide. Bien que toute autre chose - y compris une combinaison de 'ACTG' et d'autres caractères ne soit pas valide.

En fin de compte, je le retirerai de la boucle while, uniquement à des fins de test. À l'heure actuelle, je crois que tant qu'il commence par a, c, t ou g, il dit que c'est valide ...

Y a-t-il une fonction dans regex qui serait mieux adaptée que match?

import re
while (True):
    DnaString = str(input('enter your polynucleotide chain code hooblah'))
    if (re.match('([ACTG]+[ACTG]*)', DnaString, flags=0)):
        #if re.search('^ACTG', DnaString) != -1: 
            print ("valid chain.")
    else: #(re.search('^[ACTG]+[ACTG]*$', DnaString) == -1):
        print("invalid chain, please check your input.")

    if (DnaString.find("end") != -1):
        print("ohokaybye.")
        break

python regex

1

ddlem 8 mars 2016 à 06:44

Answer 1

Pourquoi pas juste

if all(c in 'ACGT' for c in DnaString):
    # Do success
else:
    # Do failure

3

BallpointBen 8 mars 2016 à 03:54

Answer 2

Si vous autorisez une correspondance à répéter en interne des caractères acceptables, cela peut être ce que vous voulez:

'[A|C|T|G]{4}'

1

Lincoln Lorscheider 8 mars 2016 à 03:55

Answer 3

Votre problème est que vous recherchez simplement les caractères ACTG n'importe où dans la chaîne sans spécifier que rien d'autre n'est autorisé. Si vous changez votre expression régulière en ^[ACTG]+$, cela fonctionnera comme prévu. Les caractères ^ et $ sont des ancres qui signifient respectivement le début et la fin de la ligne.

Ainsi, l'expression régulière ci-dessus correspond à une chaîne qui contient un ou plusieurs des quatre caractères et n'autorise aucun autre caractère ni avant ni après.

2

Zhewriix 8 mars 2016 à 03:55

caractères spécifiques aux expressions régulières python, toute combinaison

3 réponses

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