J'essaie donc de créer une clause regex où il peut détecter toute combinaison de caractères 'ACTG' et accepter cela comme valide. Bien que toute autre chose - y compris une combinaison de 'ACTG' et d'autres caractères ne soit pas valide.
En fin de compte, je le retirerai de la boucle while, uniquement à des fins de test. À l'heure actuelle, je crois que tant qu'il commence par a, c, t ou g, il dit que c'est valide ...
Y a-t-il une fonction dans regex qui serait mieux adaptée que match?
import re
while (True):
DnaString = str(input('enter your polynucleotide chain code hooblah'))
if (re.match('([ACTG]+[ACTG]*)', DnaString, flags=0)):
#if re.search('^ACTG', DnaString) != -1:
print ("valid chain.")
else: #(re.search('^[ACTG]+[ACTG]*$', DnaString) == -1):
print("invalid chain, please check your input.")
if (DnaString.find("end") != -1):
print("ohokaybye.")
break
3 réponses
Pourquoi pas juste
if all(c in 'ACGT' for c in DnaString):
# Do success
else:
# Do failure
Si vous autorisez une correspondance à répéter en interne des caractères acceptables, cela peut être ce que vous voulez:
'[A|C|T|G]{4}'
Votre problème est que vous recherchez simplement les caractères ACTG n'importe où dans la chaîne sans spécifier que rien d'autre n'est autorisé. Si vous changez votre expression régulière en ^[ACTG]+$, cela fonctionnera comme prévu. Les caractères ^ et $ sont des ancres qui signifient respectivement le début et la fin de la ligne.
Ainsi, l'expression régulière ci-dessus correspond à une chaîne qui contient un ou plusieurs des quatre caractères et n'autorise aucun autre caractère ni avant ni après.